东南大学计算机科学与工程学院起源于1960年建立的“解算装置及技术”专业，曾自主研制我国第一台数字积分机，填补了国内空白，并成功地应用于国防现代化和工业自动化领域，取得了开创性成果。1960年开始招收本科生，1979年开始招收硕士研究生，1990年开始招收博士研究生。1981年建立计算机科学与工程系，2006年建立计算机科学与工程学院。 目前，学院下设计算机科学系、计算机工程系和影像科学与技术系，拥有“计算机科学与技术”、“软件工程”两个一级学科博士点，设有“计算机科学与技术”、“软件工程”一级学科博士后流动站。二级学科“计算机应用技术”1994年被评为江苏省重点学科，1999年设立教育部长江特聘教授岗，2002年、2007年连续被评选为国家重点学科。“计算机软件与理论”2006年成为江苏省重点学科。
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